Ca peut paraître bête comme ça, mais j'ai longtemps dénigré VLC parce qu'il s'ouvrait toujours en 2 fenêtres: la fenêtre principale et celle de la playlist. En même temps j'ai pas trop poussé le bouchon pour trouver une solution, ah si... j'ai utilisé un autre lecteur, à savoir XFmedia...!

Dans VLC, il suffit donc d'aller dans paramètres > Préférences > Interface > Interfaces principales > wxWidgets, là il y a une option "Liste de lecture", et comme par miracle, on peut choisir la valeur "intégré". Du coup, on voit aussi d'autres options sympa du genre "Barre des tâches", "Icône dans la barre système", ...